為了提高檢索效率,大概有兩種思路:

  • 對(duì)文本做預(yù)處理,比如:BWT

  • 對(duì)字符串做預(yù)處理,比如:KMP、Boyer-Moore


 

BWT

[IR] BWT+MTF+AC 中已經(jīng)介紹了BWT (Burrows–Wheeler_transform)數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換算法,

這種變換方式不僅方便壓縮,同時(shí)對(duì)pattern search也帶來了意想不到的好處。

 

事實(shí)上,BWT形式的數(shù)據(jù),可以僅還原局部數(shù)據(jù),而非必須還原完整的文件。

這個(gè)完整的搜索過程叫做:FM-index,包括三部分,①BWT(T),②checkpoint data,③一個(gè)簡化了的SA[]數(shù)組。

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